Si tienes el VStudio 2003 ya tiene incluída el tipo de proyecto SmartDeviceApplication para desarrollar pocket pc applications además de que incluye el emulador para pocket.., siempre y cuando tambien tengas instalado el active sync (puede ser la ver. 3.7.1)
..mmm..

.creo que antes de que siga hablando.., primero quisiera saber si tienes VStudio Net..
Salu2