Pues no se que es esa versión de mysql, bajala directamente de la web en la sección de
Download. Bajas la que dice Generally Available (GA) release (recommended).
Ahi buscas la que corresponde a Windows y bajas la que es de 20 megas que es un zip, lo descomprimis y lo instalas.
Sobre el phpMyAdmin, la respuesta es SI, como estas trabajando con IIS, debes dejarlo en wwwroot para accesarlo.