Saludos.
Acabo de probar mi código en un archivo php y funciona perfectamente.
Fijate que el echo este mandando a imprimir la linea completa y que no estas metiendo algun final de carrera o algo asi.
Código PHP:
$servidor="156.35.130.120";
$id="24";
echo "<script>";
echo "window.alert('Fallo la conexión con el servidor". $servidor ." Tarea donde se encuentra la tarea a eliminar');";
echo "window.alert('La tarea ". $id . " Tarea no pudo ser eliminada')";
echo "</script>";
Suerte