Un problema muy frecuente..
Para dar una respuesta más explícita, se ocupa una pregunta igual.
Así que con lo que acaba de comentar podría hacer lo siguente.
Hacer 2 pruebas
una a resolución de 1024, y determinar las coordenadas de la capa:
suponiendo que son X y Y.
otra a resolución de 800x600 y determinar las coordenadas de la capa:
suponiendo que son U y V.
Entonces, hacer un script que determine la resolución del monitor y así que
escoja las coordenadas indicadas.
algo así:
<SCRIPT language="JavaScript" type="text/javascript">
if (window.screen) {
var ancho=screen.width;
var alto=screen.height;
if ((ancho<=800) || (alto<=600)) {
document.write('<Div style="top: Xpx; left: Ypx">')
}
if ((ancho>800) || (alto>600)) {
document.write('<Div style="top: Upx; left: Vpx">')
}
}
</SCRIPT>
esto para que determine la resolución y con un simple if escriba las coordenadas de la capa.
Quizá sea muy bura la respuesta, pero para dar una respuesta más propia, se nesecitan más detalles sobre tu problema..
Veo que no habían respondido, quizá por que no había muchos datos de tu problema.
Saludos...