Hola axy108.
Prueba este ejemplo:
Código HTML:
<html>
<head>
<script>
var par=false;
function parpadeo() {
document.getElementById('txt').style.visibility= (par) ? 'visible' : 'hidden';
par = !par;
}
</script>
</head>
<body onload="setInterval('parpadeo()',1000)">
Este texto <span id="txt">Parpadea</span> un poco.
</body>
</html>
Cambia el intervalo que he puesto en el body (1000 = 1 segundo) por el que mas te guste.
Saludos,