Súbelo a tu cuenta de ftp todo el directorio de phpmyadmin de tal manera que quede
http://www.tusitio.com/phpmyadmin (aunque es muy obvio adivinarlo para un cracker, pero renombra la carpeta a tu gusto)
selecciona el archivo config.inc.php y editalo
configura la linea que dice:
$cfg['PmaAbsoluteUri'] = '';
por
$cfg['PmaAbsoluteUri'] = 'http://www.tusitio.com/phpmyadmin';
Lo siguiente es configurar la autenticación con cookies
$cfg['blowfish_secret'] = 'cualquiercosa';
Luego tienes que configurar el phpmyadmin para el usuario y el servidor mysql de tu server
$cfg['Servers'][$i]['auth_type'] = 'cookie'; --> se deja igual
$cfg['Servers'][$i]['user'] = 'TU_USUARIO'; --> editar esto
$cfg['Servers'][$i]['password'] = 'TU_PASSWORD'; --> editar esto
por ultimo queda testear la dirección
http://www.tusitio.com/phpmyadmin
te pedirá clave de acuerdo al usuario y password que ud introdujo.
espero que te sirva..