Limitar descargas de carpeta desde el exterior

[execon]

Si no quieres que se vean los archivos pon un index.php con un redireccionamiento a tu web de inicio o bien con un mensaje que diga que no puedes descargar.

Si para poder verlos tienes que estar logeado en alguna parte, en ese caso usa sesiones para denegar el acceso a los archivos, asi cuando se acceda a la carpeta de forma directa sin haberse logeado arrojara un error o sera redireccionado al inicio o al login.

Si no te sirve eso tonz protege tu carpeta con password de modo que solicite una autenticacion http (.htaccess).

Espero las ideas te sirvan.