Si es posible hacerlo correr colocando directamente el archivo BAT en la carpeta Inicio.
Otra solución seria programar el programador de tareas(valga la redundancia) para que lo ejecute cada dia a la hora que deseas,ya esto depende de lo que desees hacer con el archivo bat.
Aqui donde yo trabajo lo tenemos metido en la carpeta de INICIO de los Windows NT y se ejecutan cada vez que se reinicia el ordenador,un saludo y suerte