La instrucción para que te marque el radio button está bien, el error está en la ubicación de una llave. El else lo está tomando para el if(valor), no para el if de más afuera.
Te dejo el código modificado:
<pre>
if (document.forms[0].NLocales[0].checked){
valor=window.confirm("Los valores marcados en el Local 2 y el Local 3 serán borrados ¿Desea continuar?");
if (valor) {
show('menu10');
hide('menu11');
hide('menu12');
hide('menu21');
hide('menu31');
hide('menu32');
show('local1');
hide('local2');
hide('local3');
eliminar();
}
}
else {
document.forms[0].NLocales[0].checked=true;
return false;
}
</pre>
<hr noshade size=1 color="#000000"><img src="http://www.gograph.com/Images-8712/ClipArt/cat03.gif" height="50" border=0 align="absmiddle"> <font size="2" face="verdana" color="#000000">
bet[/CODE]