Hola
Lo primero sería que te hagas con el virtualdubmod:
http://prdownloads.sourceforge.net/v...e.zip?download
Luego abre este programa, y en el menú File -> Open video file... cargas el MKV. Hará un análisis del archivo. Una vez hecho, ve al menú Streams -> Stream list y localiza la pista de audio, luego pinchas encima de ella con el botón derecho y marcas Full Processing Mode. Luego das a OK. Ahora en el menú Video seleccionas Direct Stream Copy. Finalmente vas al menú File -> Save as... y lo guardas, pero poniendo un tipo de archivo AVI (que no se te olvide). Si el tipo de audio fuera AC3 esto no funcionaría. Y si te da algún error, dime cuál es, junto a los datos de la película que los puedes obtener en el menú File -> File information.
De esta forma si funciona bien obtendrás la misma pelicula pero en formato AVI y con el audio WAV, por tanto ocupará bastante más que la original. Luego te recomiendo este manual para hacer la conversión a VCD subtitulado de forma directa:
www.mundodivx.com/subtitulos/ffdshow.php
Suerte
