Como puedo ejecutar una funcion javascript dentro del codigo php?

[kilobyte]

Para saber de esas cosas hay que comenzar a experimentar. en mi caso si está dando resultados pero no se si es exactamente lo que tu necesitas, por ejemplo para un javascript que muestra un scrool escribo el javascript y en la sección document.write doy paso a PHP y luego vuelvo al Javascript.

SERÍA CUESTIÓN de que especifiques un poco más sobre lo que quieres exactamente. Te recomiendo también que veas los temas sobre combinar PHP con HTML, te dará buenas ideas.