Como inserto un script dentro de mi main?

[Zhak]

Hola, les cuento que tengo un script de descargas y quiero insertarlo en mi main.php, pero los codigos del main hacen conflicto, es decir pongo main.php?id=descargas/index y me sale un error en el include y todo se deforma, la pregunta esta en como introducir un script en mi web, que tiene ya codigos, (ya sea phpBB, system de donwloads, galerias...)
Gracias - Zhak

PD.: No quiero usar iframe, xD