como diseñar esta tabla

[el_cesar]

Hola, tengo que armas una base de datos para almacenar unos proyectos, cada proyecto consta de 6 modulos, cada uno de ellos con unos 6 temas. Estoy trabajando em MySQL para conectarla con php y la idea es que sirva para consultar en la web.

La pregunta es, como armo esta tabla? pense en meter todos los datos en una misma, pero haciendo cuentas serian como unos 48 campos (quedaria pesada), entonces pense mejor en armar una tabla por cada modulo, pero me surge la inquietud de que como MySQL no es relacional, no se si cuando haga una consulta el me pueda agrupar los datos que corresponden a cada proyecto