Bueno . .a "javascript" no se le "pasa" ningún valor .. sino que debes pensar en que es PHP el que "crea" ese javascript. Así que si necesitas una variable que generas u obtienes desde PHP .. como estás generando "HTML/javascript/etc" en ese momento es donde debes de indicar tus variables "PHP" para que al generar toda esa página PHP tengas ahí el resultado de tu variable.
ejemplo:
Código PHP:
<a href="#" onClick="window.open('ver_nose.php?id=<? echo $row['id'] ?>','ventana','propiedades');">
Siendo "row['id']" la variable que obtengas de tu consulta a tu BD y la que usarás como referencia para abrir tu ver_nose.php que será donde hagas otra consulta SQL condicional bajo esa referencia (..... WHERE id='".$_GET['id']."'" ...) para obtener otros datos relacionados o más datos de ese registro.
un saludo,