Como exportar de una base de datos a otra? (más de 200000 datos)

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Bueno, yo no trabajo con MySQL pero lo que hago para migrar cuando la data es grande es hacerlo por partes:

Seleccionas primero los datos de la primera base, pero con condición de que el id sea >=numero inicial y <=numero final, luego se copia la consulta a la segunda base. Luego se repite la operación.en unas 20 veces habrias terminado todo. Incluso, creas un algoritmo que haga las veces necesarias automáticamente y te vaya informando el progreso, de modo que si se queda colgado o algo así sabrás exactamente en qué parte.

Lo que te digo es realmente sencillo y básico pero te aseguro que te quita muchos dolores de cabeza y largas horas de espera. Yo lo hago y me da buenos resultados, en esto no hay que complicarse tanto.