Creo que hay varias formas, yo conozco esta:
Se trata de variar la propiedad display del select según se despliege o no la capa:
Un Ejemplo...
...
function abrir(){
if (document.getElementById("Layer1").style.display== "none"){
document.getElementById("Layer1").style.display="b lock"
document.getElementById("sele1").style.display="no ne"
}
else{
document.getElementById("Layer1").style.display="n one"
document.getElementById("sele1").style.display="bl ock"
}
}
...
<div id="Layer1" style="position:absolute; left:11px; top:40px; width:297px; height:220px; z-index:1; background-color: #CC3300; layer-background-color: #CC3300; border: 1px none #000000;display:none">
</div>
<input type="button" name="buttom" value="abrir/cerrar" onClick="Javascript
:abrir()">
<p>
<select id="sele1" name="select" style="display:block">
<option value="w">w</option>
<option value="w">w</option>
<option value="w">w</option>
<option value="w">w</option>
</select>
</p>
...
espero te valga
rsalvadores