Según tengo entendido el Wine se tiene que configurar no es sólo instalarlo y no todas las aplicaciones win se pueden hacer correr con él y el WineX de igual forma. En el tema del Office prueben
http://www.openoffice.org que es muy bueno como suite de oficina y entre las opciones a destacar está el exportar los documentos a PDF y SWF directamente.
Otra opción es que tengas ambos sistemas en la máquina a usar y así cambiarte a uno u otro sólo cuando te sea necesario te dejo dos páginas de interes:
http://gnuwin.epfl.ch/es/ y
cdlibre.org