Hola que tal, mirá se me ocurre algo asi,
dentro de tu html donde va tu iframe, lo dejes dentro de un atributo p/ej:
<p id="myFrame">aca iría tu iframe </p>
No se que tipo de valores pasas del iframe (hijo) a la ventana contenedora (padre).
Pero deberias hacer que lo del iframe se guarde en el padre y cuando quieras cerrar el iframe por medio del hijo levante una funcion del padre que escriba o borre algo dentro del tag donde estaba tu iframe.
document.getElementById('myIframe').innerHTML = "" //para que se borre
Así debería funcionar, cualquier cosa me avisas.
Saludos,