tienes que validar tambien que los $Qty# sean numericos
podria resultar asi:
if( is_int($Qty1) ) mysql_query(" UPDATE qaninv SET qtys='$Qty1' ,stock=stock-$Qty1 WHERE itemid='$ItemQA031'");
y otra cosa, en todo el codigo no encontre la linea que te da el error:
$result=mysql_query($query) or die("Error in query:".mysql_error());
if ($result) |