Así es...
Pero no tienes que dejarlo vacío si no quieres. Puedes crear un index con un mensaje que diga algo o que tenga una redirección al home, por ejemplo.
Si quieres tener mayor seguridad busca cómo configurar el apache para que no te muestre la lista, pero con tener un index debería bastar. Puedes preguntar esto en el foro de servidores web>apache.
http://www.forosdelweb.com/f58/
Saludos