include("archivo.xxx");
http://www.php.net/manual/es/function.include.php
Incluye directamente todo el contenido del archivo en la línea en la que lo pongas.
fopen("archivo.xxx"); acompañado de otras funciones de archivos te permite abrir un archivo para realizar alguna acción que no necesariamente sea escribirlo todo. Puedes hacer alguna búsqueda dentro del archivo por ejemplo.
Saludos