Hola, oscargil80.
Te pongo un ejemplo con una hora de entrada y otra de salida:
Código HTML:
<html>
<head>
<script>
function horas() {
h1=new Date('01/01/2004 '+document.getElementById('HoraEntAm').value);
h2=new Date('01/01/2004 '+document.getElementById('HoraSalAm').value);
dif = new Date(h2-h1);
hora = dif.getHours()-1;
minuto = dif.getMinutes();
}
</script>
</head>
<body>
<input type="text" id="HoraEntAm" />
<input type="text" id="HoraSalAm" />
<input type="button" onclick="horas()" />
</body>
</html>
Espero que te ayude. Saludos,