Si, pero no directamente desde el proyector de flash.
Hay un programa que se llama SWF Studio que compila los SWF y tiene una lista muy extensa de FSCommand's y entre ellos, estan los que manejan la resolucion de pantalla.
fscommand("DirectDraw.SetDisplayMode", "640, 480, 32") ;
donde 32 es la profundidad de color.
Este programa lo puedes bajar de
http://www.northcode.com/