Hola Micayael, no me quedo claro si tienes o no Cpanel, pero si dispones de él podrías utilizar este script que colgo hace poco Virgil, no se si el enlace está todavía activo, si no lo esta solicitaselo, seguro que lo cuelga del server otra vez.
Con este script enlazarás a tus usuarios desde tu web con el webmail
Esta en la segunda página de este hilo:
http://www.forosdelweb.com/f19/cpanel-email-207629/
Saludos,