Respuestas
1) Puedes borrar tranquilamente el mysql y el phpMyAdmin, y despues instalarlos nuevamente.
2)No es necesario borrar al Root, simplemente es por un poco de seguridad, pero si lo quieres lo puedes dejar. tampoco hay problema
...Si tienes el Mysql y le apache funcionando no pasa nada si estas en internet..
ademas si solo los quieres para pruevas off-line no hay ningun problema.
nose si te he respuesto como querias....espero q te sirva :P