algun elemento de la configuracion, muchos perfiles de trabajos creados pueden no borrarse (borrar manualmente el directorio si es que algo quda) por lo cual puede estar alterando tu trabajo.
Algun otro software parecido o digamos el word 2003 tienen su PDF maker, alguno otro que te cause algun conflicto.
Para ver algunas referencias sobre PDF
www.gusgsm.com