Hola oscargil80:
Los popups funcionan igual en todos los navegadores, fíjate en las FAQs de este foro (la nº 100) que hay información bastante detallada sobre los popus.
Un ejemplo para abrir con un botón:
<input type="button" onclick="window.open('ventana.html', '', '')" value="abrir ventana" />
Saludos