Una ayudita

[Kelpie]

MySql guarda las bases de datos en un directorio como ficheros. El directorio se llama como la base. Podrías recorrer el directorio haciendo una copia de cada archivo en otro lugar...
Abres y recorres el directorio con opendir() y readdir() (no olvides cerrarlo con closedir())
Copias cada fichero con copy()

El problema es que probablemente no tengas permiso para acceder al directorio (por defecto están en \data\nombre_base).