Bueno, no siempre es así.
Es una costumbre muy extendida usar <a href="#" onClick="miFuncion()"...>
El asunto es que salieron unas cuantas versiones del explorer que no ejecutaban el onClick. La primera, la versión 5.0, que duró escasos meses viva, pero resulta que es la que venía por defecto en el win98 o win2k o algo así. Y luego hubo incompatibilidades entre el código en el href y en el onClick, de ahí que lo mejor sea escribir en el href="javascript
:void(0)" y en el onClick la función.