en esta pagina:
http://msdn.microsoft.com/library/sp...ssageBoxes.asp
se habla q los alert y confirm, el método prompt muestra un cuadro de mensaje modal., es decir, el usuario debe responder a él (hacer clic en un botón) y, por tanto, cerrarlo, antes de continuar.
existen no modales?
pd otras referencias de utilidad acerca de estod metodos:
http://www.wsabstract.com/javatutors/vbalert2.shtml 