La verdad me permito colocar información de otro sitio que encontré y resuelve este problema :
http://www.opensource.org.mx/listas/mysql/msg00366.html
Este sitio nos cuenta que con comentar la línea "skip-innodb" del archivo my.cfg se activa el soporte para tablas Innodb
Espero que aún les sirva o les sirva a los futuros usuarios de este foro