mira viejo, yo he tenido varias experiencias con los windows 2000 y 98 y son un poquito incompatibles pero puede lograrse la configuracion para que todas se vean, te voy a decir do o tre puntos importantes que debes checar ok?.
1. segun lo escribiste tu solo conectas las maquinas a la red y ya ¿okas?, bueno esto es por que win2000 tiene un sistema de autodeteccion de red y como detecta que las 3 maquinas tienen el mismo sist. operativo que es win2000 excluye a la de win98.
2. Debes configurar todas las maquinas manualmente para que puedan verse bien y debes cersiorarte de que todas tengan el mismo protocolo de comunicacion, ademas de el cliente para redes microsoft no debes poner ningun otro, ademas de configurar el grupo de trabajo y las ip de cada computadora.
3. si solo quieres compartir archivos ocupa el protocolo netbeui y si quieres compartir internet puedes ocupar tcp/ip.
espero que te sirva de algo mi ayuda si quieres saber algo mas puedes escribirme a
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un saludo. nos vemos :)