Si esta bien Programado. no tedra ningun problema... el uso inadecuado del _root es el problema...
Al referirte al _root te refieres a la linea de tiempo principal... supongamos que tienes 2 swf precarga.swf y contenido.swf si contenido tiene algun _root. funcionora bien ejecutando solo ese SWF por que el _root sera la linea principal de contenido.swf en cambio si lo cargas en precarga ese _root se va a referir a la linea de tiempo principal de precarga ¿me explico?...
En lugar de usar _root puedes usar this. ._parent Etc...
Saludos!!