La primer parte de multiplexar si la entendi pero lo demas no, pero pues lo primero es lo primero.
Primero debes de crear un protocolo para multiplexar los archivos.
Por ejemplo en C abres los tres archivos y otro llamado Multi.txt que sera el de salida, primero escribes en el de salida el nombre del primer archivo seguido por un "*" por ejemplo, posteriormente lees el primer archivo de principio a fin y lo escribes en el de salida, aqui pones un "/" indicando con esto que aqui abaca el primer archivo, luego lees el 2 archivo y haces lo mismo, luego el tercero. y listo cierras multi.txt y ya teines lso 3 en 1.
Para la conversion al reves pues haces al reves lees el nombre que sabes que termina hasta donde encuentres el "*", creas un archivo con ese nombre y comienzas a leer hasta que encuentres un "/", luego igaul para el siguiente archivo y asi.
Ojala te sirva, suerte...
