Hola
En virtualdubmod las opciones de sonido están en el menú Streams -> Stream list. Haces click derecho encima del audio, y ahí aparecen
![de acuerdo](http://static.forosdelweb.com/fdwtheme/images/smilies/dedosarriba.png)
Por cierto es raro que te pase sólo con OGG, quizá sea un problema de los codec que tengas instalados (sobre todo si es un pack, donde no sabes lo que instalas). El codec que yo tengo y me funciona bien es este:
http://tobias.everwicked.com/oggds.htm
Saludos