Para ejecutar comandos como los que te nombré anteriormente, tienes varas opciones:
1. Abre una consola o terminal (búscala en el menú del escritorio que estás usando).
2. Cambiarte a una terminal de texto con al combinación de teclas Ctrl+Alt+F1, loguearte como root y ejecutar los comandos (con Ctrl+Alt+F7 vuelves al entorno gráfico).
3. Otras opciones que no me acuerdo.
Y lo del espacio en disco duro, veo que ya lo descubriste por ti mismo