Revisa la aplicación:
osCommerce
www.oscommerce.com
Está lista para usarla. Tiene módulos para pagos en línea (PayPal y otras pasarelas) .. Si necesitas usar una pasarela de pago en concreto (para aceptear tarjeta de crédito directamente) contacta con tu entidad financiera (banco .. etc), ellos te proporcianran la documentación para usar sus pasarelas de pago (que son simples "links" donde apuntar tus formularios y pasar los parámetros que ellos te den como el "monto" de la compra, .. y algunos datos más que te identifiquen en el sistema ..)
Un saludo,