En tu php.ini tienes la directiva:
safe_mode_exec_dir .. por defecto está "" (sin indicar directorio) .. Puedes indicar ahí un directorio si lo deseas, pero si no cambias safe_mode a ON no afectará para nada (salvo que debería desaparecer el error .. pues parece que PHP simplemente mira esa directiva en concreto .. no si a su vez safe_mode está a ON ..)
más info y detalles en:
http://www.php.net/manual/en/features.safe-mode.php
Un saludo,