Saludos,
Bueno primero, para los marcadores amarillos que DreamWeaver va poniendo, no debes moverlos ya que ellos marcan código invisible desde el diseño, puedes configurarlos desde Preferencias, Elementos invisibles.
En lo que a el menu respecta si el segundo menú le caé encima al primero debes tener cuidado en lo siguiente, está es la forma en que es llamado el PopUp, en la última parte donde dice 'ribete' debe ir el nombre del objeto al cual está asociado el menu, debes tener cuidado de que ese nombre corresponda al nombre del link o imagen donde quieres que aparezca el menú.
onMouseOut="MM_startTimeout();" onMouseOver="MM_showMenu(window.mm_menu_ribete,26,-3,null,'ribete')