Hola chcma:
En las FAQs de javascript (la nº 100) hay información sobre los popus...
En resúmen. el tercer parámetro del método open() (del objeto window) debe ser una cadena con las opciones.
Para abrirla en la posición (0, 0) sería:
window.open(tuPágina, tuVentana, "left=0,top=0");
Saludos