Como bien te dices MC_Cameri puedes identificar al usuario por un ID unico que debe ser un campo de tipo int autoincrement ya que este no se repite. Y lo otro es que al hacer las consultas de ese usuario las haces dependiendo del ID del usuario logeado, es decir, seria algo mas o menos así:
Código PHP:
$consulta = mysql_query("UPDATE datosusuarios SET campos WHERE idusuario='usuarioactual'");
Salu2