A "javascript" no se pasan variables .. sino que es PHP el que generá el código Javascript de forma dinámica .. por ende sería algo así:,
Código PHP:
<script languaje="javascript">
var javascript='<? echo $variable_PHP ?>';
etc javascript ...
</script>
Si te fijas .. en el lugar que iría tu variable (valor) de javascript .. ahora usas PHP para darle su valor "dinámicamente" imprimiendo el valor de dicha variable PHP en es punto.
Un saludo,