Pero que deseas hacer exactamente ..
Ajustar dinámicamente el tamaño de la ventana que abres según valores que proporcionaras por PHP?
Bueno . .si es así .. tan sólo debes componer tu código javascript con las llamadas a las variabels PHP donde correspondan ..
Algo tipo:
Código PHP:
window.open('nose.tal','ventana','propiedad=<? echo $valor ?>,propiedad2=<? echo $valor2 ?>');
Cuando hablas de "tabla" no sé si te refieres a una tabla HTML que se va a generar a partir de PHP .. ?¿ ...
Otro tipo de ajustes sobre la ventana en sí deberías resolverlo en javacript si es posible .. PHP no puede controlar más sobre "ventanas" más que generar el código que las crea .. pero como lo haga o represente el "cliente" (navegador) ya es cosa de Javascript/HTML .. etc.
Un saludo,