Bueno, parece que con esos valores si deberia entrar en el if. Entonces toca comprobar la consulta. Hay que comprobar que no se produce un error MySQL con mysql_error():
Código PHP:
mysql_query("INSERT INTO `visitas_unicas` (`fecha` , `hoy` ,`ip`) VALUES ('$dia[0]','$hoy','$REMOTE_ADDR')") or die('Error MySQL dice: '.mysql_error());
Suerte.