Hola ray_rockus:
Supongo que no tendría que haber problemas, pero hay un truco para simular que se cambian los mapas y sus areas...
... al menos se simula bastante bien ocultando las capas que no se necesitan y mostrando las capas seleccionadas con display=block en un div con un mapa y su usemap, y el resto de mapas (y areas) con display: none...
Si puedes darnos más información creo que sería mejor.
Saludos