Con virtualdubmod, aplicando filtros. Basicamente lo que tienes que hacer es:
- Tener el codec que quieras usar para comprimir bien instalado (puede ser DivX, XviD, u otro)
- Abres la peli, y en Video -> Filters añades el filtro "Rotate" y lo configuras.
- Luego en Video -> Compression seleccionas el codec que quieras usar y lo configuras (bitrate y todo eso).
- Te aseguras que en Video esté marcado Full Processing Mode
- Finalmente en File -> Save as... lo guardas.
Llevará algún tiempo el proceso, asi que no desesperes.
Espero que te sirva