Ok, fijate una cosa, lo primero que te diría es que no uses capas para meter iframes a menos que seas un Dios manejando las capas, personalmente a mi, me parecen muy tediosas, aunque puedes hacer cosas increibles con las capas.
Bien, mira lo que vas a hacer.
1.-Imagino que trabajas con Dreamweaver, si lo haces, primero trabaja en la vista de dispocisión para que puedas dibujar celdas donde te de la gana.
2.-Luego que hayas creado la celda, cambia a la vista estandar y inserta una tabla en donde esta la celda.
3.-Dentro de la tabla, pones el codigo del iframe y listo, cuando quieras mover el Iframe solo te cambias a la vista de disposicion y mueves la celda donde esta el iframe y la tabla.
Espero esto te sirva, ya sabes que cualquier cosas pegas otro grito.
