El problema que tenes es que queres instalar win98 sobre particiones NTFS, o sea, que antes tenías instalado un 2000 o XP y el win98 no lee ese sistema de archivos. Para poder eliminarlos, debes usar el FDISK siempre y cuando sea una sola partición. Entra a
Preguntas frecuentes de Windows de estos foros. Ahí busca la parte que dice
Fdisk, hay varias guías muy explicativas para formatear y usar el fdisk.