hice un pequeño ejemplo, aqui el html
<html>
<body>
<form name="cheques" action="verlo.php" method="post">
<table>
<tr>
<td>
<input type="checkbox" name="grupo1_1" value="algo1"><br>
<input type="checkbox" name="grupo1_2" value="algo2"><br>
<input type="checkbox" name="grupo1_3" value="algo3"><br>
</td>
<td>
<input type="checkbox" name="grupo2_1" value="algo4"><br>
<input type="checkbox" name="grupo2_2" value="algo5"><br>
<input type="checkbox" name="grupo2_3" value="algo6"><br>
</td>
</tr>
</table>
<input type="submit" name="grabar" value="Enviar">
</form>
</body>
</html>
aqui el php:
<?php
for ($i=1;$i<=3;$i++)
{
$var1="grupo1_".$i;
$var2="grupo2_".$i;
echo $_POST[$var1]." ".$_POST[$var2]."<br>";
}
?>
funciona bien.