Si el servidor no soporta los SSI dudo que tú puedas hacer algo, salvo si el servidor es tuyo
Ahora mismo no se me ocurre una alternativa a los SSI salvo los frames o iframes, aunque si la parte a incluír no es demasiado extensa podrías hacer que se escriba el código desde javascript metido en un archivo de tipo *.js que fuera incluído en todas tus páginas
